Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPS9P82933 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS9P82933 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MRPS9P82933 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPS9P82933 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPS9P82933 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms