Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 YHL008CYHL008C 1884 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG2P53855 VMA3YEL027W 483 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG2P53855 RIM8YGL045W 1629 nt11.33□□□□□ -0.6
ATG2P53855 ZWF1YNL241C 1518 nt11.32□□□□□ -0.6
ATG2P53855 AVL9YLR114C 2295 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG2P53855 YLL056CYLL056C 897 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG2P53855 TIF2YJL138C 1188 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG2P53855 TIF1YKR059W 1188 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG2P53855 MSP1YGR028W 1089 nt11.28□□□□□ -0.6
ATG2P53855 MOG1YJR074W 657 nt11.28□□□□□ -0.6
ATG2P53855 RDR1YOR380W 1641 nt11.27□□□□□ -0.6
ATG2P53855 CKB1YGL019W 837 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG2P53855 ORT1YOR130C 879 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG2P53855 PFS2YNL317W 1398 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG2P53855 PEX3YDR329C 1326 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG2P53855 ICP55YER078C 1536 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG2P53855 OM45YIL136W 1182 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG2P53855 IVY1YDR229W 1362 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG2P53855 CUE4YML101C 354 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG2P53855 NAS6YGR232W 687 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG2P53855 SEN34YAR008W 828 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG2P53855 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG2P53855 YGL102CYGL102C 429 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG2P53855 CSL4YNL232W 879 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG2P53855 YBR027CYBR027C 333 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG2P53855 ERG24YNL280C 1317 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG2P53855 PGI1YBR196C 1665 nt11.21□□□□□ -0.62
ATG2P53855 MRPL10YNL284C 969 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG2P53855 MHT1YLL062C 975 nt11.2□□□□□ -0.62
ATG2P53855 AFG3YER017C 2286 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG2P53855 ERG8YMR220W 1356 nt11.19□□□□□ -0.62
ATG2P53855 YGL114WYGL114W 2178 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG2P53855 CUP2YGL166W 678 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG2P53855 SMX3YPR182W 261 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG2P53855 DUS3YLR401C 2007 nt11.18□□□□□ -0.62
ATG2P53855 DSF1YEL070W 1509 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG2P53855 YNR073CYNR073C 1509 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG2P53855 SNA3YJL151C 402 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG2P53855 HNM1YGL077C 1692 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG2P53855 EGD2YHR193C 525 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG2P53855 TPO4YOR273C 1980 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG2P53855 HMG2YLR450W 3138 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG2P53855 HED1YDR014W-A 489 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG2P53855 REC107YJR021C 945 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG2P53855 SUR7YML052W 909 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG2P53855 CYT1YOR065W 930 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG2P53855 HIS1YER055C 894 nt11.14□□□□□ -0.63
ATG2P53855 LIP5YOR196C 1245 nt11.14□□□□□ -0.63
ATG2P53855 PDC5YLR134W 1692 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG2P53855 DON1YDR273W 1098 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG2P53855 ERG27YLR100W 1044 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG2P53855 ELA1YNL230C 1140 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG2P53855 RPL43AYPR043W 279 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG2P53855 PRI1YIR008C 1230 nt11.12□□□□□ -0.63
ATG2P53855 SNN1YNL086W 309 nt11.12□□□□□ -0.63
ATG2P53855 HPT1YDR399W 666 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG2P53855 GTS1YGL181W 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG2P53855 YPR196WYPR196W 1413 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG2P53855 YMR279CYMR279C 1623 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG2P53855 NBA1YOL070C 1506 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG2P53855 SYF2YGR129W 648 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG2P53855 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG2P53855 ADE2YOR128C 1716 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG2P53855 CDC7YDL017W 1524 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG2P53855 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 HSL7YBR133C 2484 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 DLD1YDL174C 1764 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 PMT1YDL095W 2454 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG2P53855 YKL077WYKL077W 1179 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG2P53855 HVG1YER039C 750 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG2P53855 PTC7YHR076W 1032 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG2P53855 YAL045CYAL045C 309 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG2P53855 SEC62YPL094C 825 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG2P53855 MPC2YHR162W 390 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG2P53855 MRPL23YOR150W 492 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG2P53855 snR4snR4 186 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG2P53855 FRA1YLL029W 2250 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG2P53855 UIP5YKR044W 1332 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG2P53855 ECM19YLR390W 339 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG2P53855 SPG5YMR191W 1122 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG2P53855 RNH1YMR234W 1047 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG2P53855 YDL172CYDL172C 480 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG2P53855 TPI1YDR050C 747 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG2P53855 YNL200CYNL200C 741 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG2P53855 ERP5YHR110W 639 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG2P53855 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.1 ms