Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNHP51946 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNHP51946 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNHP51946 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNHP51946 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNHP51946 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNHP51946 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNHP51946 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNHP51946 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNHP51946 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNHP51946 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNHP51946 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNHP51946 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNHP51946 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNHP51946 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNHP51946 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNHP51946 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNHP51946 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNHP51946 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNHP51946 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNHP51946 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNHP51946 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNHP51946 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNHP51946 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNHP51946 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNHP51946 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNHP51946 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNHP51946 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNHP51946 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNHP51946 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNHP51946 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNHP51946 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNHP51946 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNHP51946 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNHP51946 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNHP51946 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNHP51946 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNHP51946 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNHP51946 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNHP51946 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNHP51946 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms