Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAPOLAP51003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAPOLAP51003 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAPOLAP51003 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms