Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX2P50458 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX2P50458 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX2P50458 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX2P50458 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX2P50458 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX2P50458 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX2P50458 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX2P50458 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX2P50458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX2P50458 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX2P50458 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX2P50458 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX2P50458 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX2P50458 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX2P50458 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX2P50458 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX2P50458 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX2P50458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX2P50458 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX2P50458 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX2P50458 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX2P50458 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX2P50458 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX2P50458 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX2P50458 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX2P50458 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX2P50458 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX2P50458 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX2P50458 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX2P50458 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX2P50458 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX2P50458 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX2P50458 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX2P50458 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX2P50458 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX2P50458 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX2P50458 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX2P50458 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX2P50458 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX2P50458 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX2P50458 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX2P50458 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX2P50458 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX2P50458 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX2P50458 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX2P50458 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX2P50458 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX2P50458 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX2P50458 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX2P50458 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX2P50458 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX2P50458 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX2P50458 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX2P50458 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX2P50458 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LHX2P50458 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX2P50458 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX2P50458 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX2P50458 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX2P50458 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX2P50458 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX2P50458 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX2P50458 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX2P50458 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX2P50458 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX2P50458 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX2P50458 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX2P50458 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX2P50458 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX2P50458 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX2P50458 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX2P50458 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX2P50458 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX2P50458 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX2P50458 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms