Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRIM2P49643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRIM2P49643 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRIM2P49643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRIM2P49643 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms