Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX1P48742 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX1P48742 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX1P48742 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX1P48742 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX1P48742 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX1P48742 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX1P48742 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX1P48742 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX1P48742 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX1P48742 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX1P48742 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX1P48742 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX1P48742 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX1P48742 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX1P48742 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX1P48742 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX1P48742 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX1P48742 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX1P48742 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX1P48742 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX1P48742 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX1P48742 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX1P48742 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX1P48742 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX1P48742 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX1P48742 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX1P48742 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX1P48742 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX1P48742 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX1P48742 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX1P48742 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX1P48742 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX1P48742 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LHX1P48742 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX1P48742 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX1P48742 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX1P48742 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX1P48742 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX1P48742 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX1P48742 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LHX1P48742 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX1P48742 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX1P48742 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX1P48742 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX1P48742 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX1P48742 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX1P48742 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LHX1P48742 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX1P48742 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX1P48742 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX1P48742 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX1P48742 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX1P48742 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX1P48742 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX1P48742 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX1P48742 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX1P48742 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX1P48742 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX1P48742 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX1P48742 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX1P48742 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LHX1P48742 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX1P48742 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX1P48742 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX1P48742 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX1P48742 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX1P48742 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX1P48742 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX1P48742 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX1P48742 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX1P48742 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX1P48742 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX1P48742 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX1P48742 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX1P48742 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX1P48742 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX1P48742 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHX1P48742 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX1P48742 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX1P48742 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX1P48742 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX1P48742 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX1P48742 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX1P48742 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHX1P48742 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms