Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNC1P48547 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNC1P48547 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC1P48547 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms