Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RECQLP46063 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RECQLP46063 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RECQLP46063 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RECQLP46063 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RECQLP46063 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RECQLP46063 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RECQLP46063 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RECQLP46063 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RECQLP46063 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RECQLP46063 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RECQLP46063 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RECQLP46063 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RECQLP46063 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RECQLP46063 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RECQLP46063 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RECQLP46063 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RECQLP46063 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RECQLP46063 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RECQLP46063 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RECQLP46063 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RECQLP46063 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RECQLP46063 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RECQLP46063 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RECQLP46063 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RECQLP46063 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RECQLP46063 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RECQLP46063 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RECQLP46063 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RECQLP46063 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RECQLP46063 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RECQLP46063 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RECQLP46063 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RECQLP46063 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RECQLP46063 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RECQLP46063 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RECQLP46063 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RECQLP46063 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RECQLP46063 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RECQLP46063 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RECQLP46063 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RECQLP46063 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RECQLP46063 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RECQLP46063 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RECQLP46063 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RECQLP46063 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RECQLP46063 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RECQLP46063 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RECQLP46063 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RECQLP46063 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RECQLP46063 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RECQLP46063 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RECQLP46063 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RECQLP46063 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RECQLP46063 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RECQLP46063 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RECQLP46063 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RECQLP46063 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RECQLP46063 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RECQLP46063 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RECQLP46063 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RECQLP46063 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RECQLP46063 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RECQLP46063 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RECQLP46063 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RECQLP46063 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RECQLP46063 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RECQLP46063 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms