Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDSP41222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTGDSP41222 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms