Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.025e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.265e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.45e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-210ENST00000444119 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.595e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -15e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.125e-11■■■■■ 49.9
GTF2F1P35269 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 49.7
GTF2F1P35269 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 49.7
GTF2F1P35269 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 49.7
GTF2F1P35269 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 419.95■□□□□ 0.789e-10■■■■■ 49.6
GTF2F1P35269 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 417.77■□□□□ 0.449e-10■■■■■ 49.6
GTF2F1P35269 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.189e-10■■■■■ 49.6
GTF2F1P35269 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.66□□□□□ -1.829e-10■■■■■ 49.6
GTF2F1P35269 SETD1A-202ENST00000452917 315 ntTSL 224.74■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 49.6
GTF2F1P35269 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 215.95■□□□□ 0.144e-11■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 MTPN-202ENST00000435723 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.967e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.345e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 222.76■■□□□ 1.235e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 49.5
GTF2F1P35269 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-42■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 IRF3-218ENST00000597369 550 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-14■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 53.57□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 419.71■□□□□ 0.751e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 417.33■□□□□ 0.361e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 47.81□□□□□ -1.161e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 37.3□□□□□ -1.241e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 45.92□□□□□ -1.461e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 43.65□□□□□ -1.831e-12■■■■■ 49.4
GTF2F1P35269 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 221.99■■□□□ 1.117e-10■■■■■ 49.3
GTF2F1P35269 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.67e-10■■■■■ 49.3
GTF2F1P35269 CNOT2-220ENST00000549750 1085 ntTSL 515.43■□□□□ 0.067e-10■■■■■ 49.3
GTF2F1P35269 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 49.3
GTF2F1P35269 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 49.3
GTF2F1P35269 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.74■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.34■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.13■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.76□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.466e-7■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 49.1
GTF2F1P35269 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.111e-13■■■■■ 49
GTF2F1P35269 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.424e-10■■■■■ 49
GTF2F1P35269 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-10■■■■■ 49
GTF2F1P35269 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 49
GTF2F1P35269 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.87□□□□□ -1.475e-13■■■■■ 48.9
GTF2F1P35269 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 48.9
GTF2F1P35269 POLE-208ENST00000535934 1561 ntTSL 515.81■□□□□ 0.125e-10■■■■■ 48.9
GTF2F1P35269 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.881e-10■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 TSPAN32-211ENST00000484104 725 ntTSL 222.17■■□□□ 1.149e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 TSPAN32-205ENST00000437313 734 ntTSL 521.43■■□□□ 1.029e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 TSPAN32-215ENST00000493948 641 ntTSL 320.6■□□□□ 0.899e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.35e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LIPE-AS1-202ENST00000593491 292 ntTSL 216.21■□□□□ 0.195e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.121e-10■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.085e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.045e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LIPE-AS1-207ENST00000597203 556 ntTSL 414.76□□□□□ -0.055e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.065e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.065e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.195e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-207ENST00000507851 814 ntTSL 312.19□□□□□ -0.465e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LIPE-AS1-208ENST00000599276 251 ntTSL 512.11□□□□□ -0.475e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-201ENST00000381799 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-211ENST00000513894 571 ntTSL 411.11□□□□□ -0.635e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-202ENST00000503754 557 ntTSL 410.99□□□□□ -0.655e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-205ENST00000504638 530 ntTSL 210.82□□□□□ -0.685e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-208ENST00000508513 874 ntTSL 39.64□□□□□ -0.875e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-203ENST00000503941 789 ntTSL 29.63□□□□□ -0.875e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-209ENST00000511121 571 ntTSL 29.11□□□□□ -0.955e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-215ENST00000515702 574 ntTSL 48.48□□□□□ -1.055e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-210ENST00000511967 423 ntTSL 38.46□□□□□ -1.065e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-216ENST00000515718 574 ntTSL 47.83□□□□□ -1.165e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-204ENST00000503978 545 ntTSL 47.04□□□□□ -1.285e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-214ENST00000515503 549 ntTSL 46.16□□□□□ -1.425e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.495e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 RHOH-213ENST00000514839 560 ntTSL 45.61□□□□□ -1.515e-12■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.529e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 216.92■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 MTSS1-212ENST00000522162 553 ntTSL 47.63□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 48.7
GTF2F1P35269 PPP6R3-215ENST00000528635 538 ntTSL 417.37■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-217ENST00000529344 603 ntTSL 417.37■□□□□ 0.373e-12■■■■■ 48.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 51.8 ms