Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMLP29590 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMLP29590 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMLP29590 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PMLP29590 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PMLP29590 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMLP29590 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMLP29590 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMLP29590 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMLP29590 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMLP29590 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMLP29590 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMLP29590 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMLP29590 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMLP29590 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMLP29590 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMLP29590 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMLP29590 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMLP29590 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMLP29590 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMLP29590 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMLP29590 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMLP29590 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PMLP29590 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMLP29590 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMLP29590 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMLP29590 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PMLP29590 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMLP29590 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMLP29590 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMLP29590 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMLP29590 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMLP29590 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PMLP29590 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMLP29590 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMLP29590 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMLP29590 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMLP29590 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMLP29590 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMLP29590 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMLP29590 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMLP29590 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMLP29590 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMLP29590 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMLP29590 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMLP29590 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMLP29590 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMLP29590 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMLP29590 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMLP29590 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMLP29590 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PMLP29590 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMLP29590 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMLP29590 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMLP29590 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMLP29590 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMLP29590 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMLP29590 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMLP29590 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMLP29590 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PMLP29590 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMLP29590 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMLP29590 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMLP29590 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PMLP29590 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms