Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFKBIAP25963 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKBIAP25963 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIAP25963 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms