Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP5F1P24539 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5F1P24539 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5F1P24539 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5F1P24539 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms