Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITPKAP23677 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITPKAP23677 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITPKAP23677 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITPKAP23677 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms