Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRDP23468 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRDP23468 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRDP23468 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRDP23468 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRDP23468 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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