Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRKACBP22694 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKACBP22694 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKACBP22694 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms