Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGFR3P22607 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR3P22607 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR3P22607 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FGFR3P22607 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR3P22607 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms