Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCP2P22307 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCP2P22307 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCP2P22307 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCP2P22307 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCP2P22307 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCP2P22307 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCP2P22307 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCP2P22307 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCP2P22307 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCP2P22307 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCP2P22307 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCP2P22307 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCP2P22307 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCP2P22307 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCP2P22307 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCP2P22307 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCP2P22307 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCP2P22307 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCP2P22307 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCP2P22307 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCP2P22307 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCP2P22307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCP2P22307 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCP2P22307 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCP2P22307 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCP2P22307 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCP2P22307 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCP2P22307 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCP2P22307 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCP2P22307 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCP2P22307 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCP2P22307 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCP2P22307 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCP2P22307 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCP2P22307 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCP2P22307 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCP2P22307 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCP2P22307 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCP2P22307 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCP2P22307 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCP2P22307 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCP2P22307 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCP2P22307 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCP2P22307 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCP2P22307 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCP2P22307 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCP2P22307 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCP2P22307 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCP2P22307 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCP2P22307 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCP2P22307 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCP2P22307 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCP2P22307 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCP2P22307 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCP2P22307 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCP2P22307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCP2P22307 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCP2P22307 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCP2P22307 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCP2P22307 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCP2P22307 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCP2P22307 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms