Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCL3L1P16619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL3L1P16619 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms