Protein–RNA interactions for Protein: P16442

ABO, Histo-blood group ABO system transferase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABOP16442 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABOP16442 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABOP16442 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABOP16442 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABOP16442 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABOP16442 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABOP16442 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABOP16442 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABOP16442 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABOP16442 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABOP16442 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABOP16442 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABOP16442 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABOP16442 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABOP16442 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABOP16442 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABOP16442 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABOP16442 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABOP16442 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABOP16442 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABOP16442 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABOP16442 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABOP16442 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABOP16442 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABOP16442 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABOP16442 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABOP16442 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABOP16442 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABOP16442 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABOP16442 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABOP16442 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABOP16442 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABOP16442 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABOP16442 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABOP16442 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABOP16442 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABOP16442 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABOP16442 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABOP16442 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABOP16442 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABOP16442 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABOP16442 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABOP16442 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABOP16442 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABOP16442 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABOP16442 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABOP16442 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABOP16442 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABOP16442 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABOP16442 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABOP16442 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABOP16442 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABOP16442 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABOP16442 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABOP16442 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABOP16442 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABOP16442 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABOP16442 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABOP16442 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABOP16442 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABOP16442 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABOP16442 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABOP16442 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABOP16442 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABOP16442 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABOP16442 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABOP16442 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ABOP16442 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABOP16442 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms