Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAG1P15918 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAG1P15918 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAG1P15918 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAG1P15918 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAG1P15918 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAG1P15918 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAG1P15918 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAG1P15918 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAG1P15918 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAG1P15918 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RAG1P15918 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAG1P15918 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAG1P15918 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAG1P15918 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAG1P15918 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAG1P15918 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RAG1P15918 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAG1P15918 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAG1P15918 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAG1P15918 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAG1P15918 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAG1P15918 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAG1P15918 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAG1P15918 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAG1P15918 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAG1P15918 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAG1P15918 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAG1P15918 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAG1P15918 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAG1P15918 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAG1P15918 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAG1P15918 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAG1P15918 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAG1P15918 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAG1P15918 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG1P15918 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAG1P15918 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RAG1P15918 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RAG1P15918 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAG1P15918 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG1P15918 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAG1P15918 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAG1P15918 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAG1P15918 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAG1P15918 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RAG1P15918 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAG1P15918 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAG1P15918 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAG1P15918 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAG1P15918 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAG1P15918 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAG1P15918 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms