Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB3P14651 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB3P14651 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB3P14651 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms