Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NID1P14543 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NID1P14543 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NID1P14543 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NID1P14543 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NID1P14543 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NID1P14543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NID1P14543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NID1P14543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NID1P14543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NID1P14543 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NID1P14543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NID1P14543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NID1P14543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NID1P14543 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NID1P14543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NID1P14543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NID1P14543 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NID1P14543 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NID1P14543 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NID1P14543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NID1P14543 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NID1P14543 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NID1P14543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NID1P14543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NID1P14543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NID1P14543 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NID1P14543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NID1P14543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NID1P14543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NID1P14543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NID1P14543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NID1P14543 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NID1P14543 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NID1P14543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NID1P14543 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NID1P14543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NID1P14543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NID1P14543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NID1P14543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NID1P14543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NID1P14543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NID1P14543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NID1P14543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NID1P14543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NID1P14543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NID1P14543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NID1P14543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NID1P14543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NID1P14543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NID1P14543 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NID1P14543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NID1P14543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NID1P14543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NID1P14543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NID1P14543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NID1P14543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms