Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACTN1P12814 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN1P12814 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN1P12814 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN1P12814 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms