Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SKIP12755 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SKIP12755 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SKIP12755 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SKIP12755 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIP12755 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIP12755 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIP12755 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIP12755 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIP12755 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIP12755 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIP12755 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIP12755 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIP12755 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIP12755 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIP12755 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIP12755 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIP12755 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIP12755 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIP12755 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIP12755 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIP12755 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIP12755 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIP12755 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIP12755 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIP12755 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIP12755 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIP12755 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIP12755 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIP12755 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIP12755 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIP12755 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIP12755 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIP12755 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIP12755 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIP12755 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIP12755 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIP12755 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIP12755 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIP12755 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIP12755 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIP12755 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIP12755 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIP12755 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIP12755 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIP12755 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIP12755 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIP12755 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIP12755 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIP12755 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIP12755 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIP12755 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKIP12755 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms