Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
TOP2AP11388 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
TOP2AP11388 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
TOP2AP11388 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
TOP2AP11388 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC44.45■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
TOP2AP11388 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.7
TOP2AP11388 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.32■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms