Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GIMD1P0DJR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GIMD1P0DJR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GIMD1P0DJR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GIMD1P0DJR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms