Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POP4O95707 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP4O95707 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP4O95707 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP4O95707 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POP4O95707 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POP4O95707 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POP4O95707 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POP4O95707 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POP4O95707 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POP4O95707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP4O95707 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POP4O95707 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP4O95707 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POP4O95707 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP4O95707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP4O95707 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP4O95707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POP4O95707 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POP4O95707 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP4O95707 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP4O95707 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP4O95707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POP4O95707 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POP4O95707 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POP4O95707 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POP4O95707 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP4O95707 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POP4O95707 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POP4O95707 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP4O95707 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POP4O95707 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POP4O95707 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP4O95707 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POP4O95707 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP4O95707 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POP4O95707 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP4O95707 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POP4O95707 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POP4O95707 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP4O95707 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP4O95707 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POP4O95707 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP4O95707 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP4O95707 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP4O95707 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POP4O95707 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
POP4O95707 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POP4O95707 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POP4O95707 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POP4O95707 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POP4O95707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP4O95707 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP4O95707 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP4O95707 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POP4O95707 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POP4O95707 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP4O95707 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POP4O95707 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POP4O95707 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP4O95707 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP4O95707 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP4O95707 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POP4O95707 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP4O95707 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP4O95707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POP4O95707 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POP4O95707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms