Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM3O75382 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM3O75382 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM3O75382 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM3O75382 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM3O75382 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM3O75382 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM3O75382 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms