Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIA2O75334 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPFIA2O75334 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPFIA2O75334 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPFIA2O75334 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms