Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF2O60811 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF2O60811 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF2O60811 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms