Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPX2O60687 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPX2O60687 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPX2O60687 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPX2O60687 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms