Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN3O60637 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSPAN3O60637 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN3O60637 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN3O60637 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN3O60637 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms