Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUPR1O60356 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUPR1O60356 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUPR1O60356 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUPR1O60356 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms