Protein–RNA interactions for Protein: O43929

ORC4, Origin recognition complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC4O43929 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ORC4O43929 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ORC4O43929 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ORC4O43929 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ORC4O43929 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ORC4O43929 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ORC4O43929 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ORC4O43929 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ORC4O43929 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ORC4O43929 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ORC4O43929 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ORC4O43929 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ORC4O43929 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ORC4O43929 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ORC4O43929 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ORC4O43929 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ORC4O43929 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ORC4O43929 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ORC4O43929 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ORC4O43929 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ORC4O43929 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ORC4O43929 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ORC4O43929 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ORC4O43929 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ORC4O43929 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ORC4O43929 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ORC4O43929 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ORC4O43929 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ORC4O43929 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ORC4O43929 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ORC4O43929 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ORC4O43929 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ORC4O43929 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ORC4O43929 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ORC4O43929 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ORC4O43929 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ORC4O43929 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ORC4O43929 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ORC4O43929 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ORC4O43929 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ORC4O43929 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ORC4O43929 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ORC4O43929 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ORC4O43929 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ORC4O43929 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ORC4O43929 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ORC4O43929 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ORC4O43929 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ORC4O43929 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ORC4O43929 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ORC4O43929 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ORC4O43929 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ORC4O43929 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ORC4O43929 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ORC4O43929 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ORC4O43929 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ORC4O43929 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ORC4O43929 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ORC4O43929 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ORC4O43929 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ORC4O43929 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ORC4O43929 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ORC4O43929 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ORC4O43929 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ORC4O43929 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ORC4O43929 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ORC4O43929 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ORC4O43929 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ORC4O43929 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ORC4O43929 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ORC4O43929 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ORC4O43929 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ORC4O43929 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ORC4O43929 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ORC4O43929 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ORC4O43929 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ORC4O43929 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ORC4O43929 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms