Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDT21O43809 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUDT21O43809 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NUDT21O43809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUDT21O43809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms