Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGTAO43765 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGTAO43765 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGTAO43765 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGTAO43765 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGTAO43765 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGTAO43765 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGTAO43765 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGTAO43765 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGTAO43765 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGTAO43765 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGTAO43765 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGTAO43765 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGTAO43765 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGTAO43765 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms