Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYTH3O43739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYTH3O43739 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYTH3O43739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYTH3O43739 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYTH3O43739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1157.4 ms