Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD28O15084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ANKRD28O15084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD28O15084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ANKRD28O15084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms