Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SETD1AO15047 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.3
SETD1AO15047 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
SETD1AO15047 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SETD1AO15047 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SETD1AO15047 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SETD1AO15047 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms