Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DYNC1I1O14576 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DYNC1I1O14576 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DYNC1I1O14576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DYNC1I1O14576 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DYNC1I1O14576 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms