Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHLHE40O14503 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE40O14503 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE40O14503 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms