Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC01387J3KSC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC01387J3KSC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC01387J3KSC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms