Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHLA1C9JL84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHLA1C9JL84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HHLA1C9JL84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HHLA1C9JL84 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HHLA1C9JL84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms