Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C9J4A7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9J4A7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9J4A7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9J4A7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9J4A7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9J4A7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9J4A7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9J4A7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9J4A7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9J4A7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9J4A7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9J4A7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9J4A7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9J4A7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9J4A7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9J4A7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9J4A7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9J4A7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9J4A7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9J4A7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9J4A7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9J4A7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9J4A7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9J4A7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9J4A7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9J4A7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9J4A7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9J4A7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9J4A7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9J4A7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9J4A7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9J4A7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9J4A7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9J4A7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9J4A7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9J4A7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9J4A7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9J4A7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9J4A7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9J4A7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9J4A7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C9J4A7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9J4A7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9J4A7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C9J4A7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9J4A7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9J4A7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C9J4A7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9J4A7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9J4A7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms