Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00587B1AMM8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LINC00587B1AMM8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms