Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRRM3A6NNA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRM3A6NNA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRM3A6NNA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRM3A6NNA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms