Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP73A6NFT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP73A6NFT4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms