Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM149AA5PLN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM149AA5PLN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM149AA5PLN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM149AA5PLN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM149AA5PLN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms